“基因定位与育种设计”作科所培训班通知
应我所广大科研人员和研究生的要求,数量遗传课题组将在作科所内部举办一期“基因定位与育种设计”培训。内容包括遗传群体及其构建、表型数据分析和遗传力估计、群体和数量遗传基础、标记间重组率估计和连锁图谱构建、不同群体连锁图谱的整合、基因定位原理和方法、关联分析原理和方法、无性系和多亲群体的遗传分析方法、全基因组选择方法等,详细日程和回执附后。
参加人员为作科所遗传育种领域的科研人员和研究生,具备遗传学、育种学、生物统计和计算机等方面的基本知识;自带安装有Windows操作系统的笔记本电脑,鼓励携带自己的遗传群体或育种数据参会;提供简单的工作午餐,不收取培训费。本次培训班由2015年农科院科技创新工程-作物生物信息学及应用团队经费赞助。
时间:2015年8月24 - 28日
地点:中国农业科学院作物科学研究所育种楼718会议室
规模:50人左右(报名截止时间为2015年8月10日;场地所限,超过50人时,按报名先后顺序参加)
联系人:钱亚红(qianyahong@caas.cn; 86 10 82106038; 18001126271)
详细日程安排
作息时间:上午9:00~12:30上课、12:30~13:30午餐、下午13:30~17:00上课。
8月24日:以群体和数量遗传学为主,内容包括群体结构估计,影响群体结构的因素,表型数据方差分析和广义遗传力估计,遗传效应和遗传方差的分解,亲属间的遗传相关和遗传交配设计,狭义遗传力估计,遗传进度估计,相关遗传进度,选择指数,利用Excel进行简单的统计和遗传分析等内容。
8月25日:以连锁分析和遗传图谱构建为主,内容包括遗传学基本规律,两个连锁座位之间的重组率估计,三个座位间的遗传干涉和遗传图距,大量标记的分群和排序,利用QTL IciMapping软件估计重组率、构建连锁图谱、整合多条连锁图谱等内容。
8月26日:以双亲群体加显性QTL作图为主,内容包括QTL作图的基本原理,单标记QTL作图方法,简单区间作图方法,背景遗传变异控制的重要性,完备区间作图方法,QTL作图中的两类错误,不同QTL作图方法的比较,利用QTL IciMapping软件开展QTL作图研究、模拟遗传群体、比较不同方法的QTL检测功效等内容。
8月27日:以双亲群体互作QTL作图和其它群体基因定位方法为主,内容包括上位型互作QTL作图,QTL与环境的互作分析,选择基因型分析,混合分离分析,染色体片段置换系群体的QTL作图,关联分析,QTL作图常见问题解析,利用QTL IciMapping软件开展互作QTL作图研究等内容。
8月28日:上午以无性系物种的遗传分析方法为主,内容包括无性系遗传群体的连锁分析、连锁图谱构建和基因定位方法;下午以育种模拟和育种设计为主,内容包括植物育种方法和程序,植物育种过程的建模和模拟,不同育种方法的模拟比较,已知基因信息的育种设计,利用QuGene和QuLine软件模拟育种过程等内容;最后两个小时为自由讨论和交流,包括对培训班的意见和建议,研究过程中遇到的遗传学和统计学问题等。
“基因定位与育种设计”作科所培训班回执
(8月10日前Email联系人)
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