作科所揭示中国主要稻区水稻品种形成特征助力精准设计育种
3月13日，中国农业科学院作物科学研究所水稻优异种质资源发掘与创新利用、作物种质资源安全保存与信息化、作物生物信息与应用创新团队联合，首次系统揭示了中国主要稻区水稻品种的形成特征，相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
我国每年水稻种植面积超过4亿亩，覆盖了从热带到寒温带的各类气候区，形成了各具特色的六大水稻种植区。经过几十年持续的遗传改良，培育了成千上万个区域适应性优良品种。系统解析各稻区表型、基因型选择特征，挖掘优异种质基因及其组合，对加速我国水稻精准设计育种具有重要意义。
研究团队对我国五大主要稻区的6044份现代水稻品种进行深度全基因组重测序，结合五大稻区19个鉴定点212组表型数据，系统阐明了不同稻区水稻品种基因组和表型选择特征，多维度揭示了不同稻区品种适应性以及人文选择影响。基于以上数据，鉴定到3131个与抽穗期、产量以及逆境响应等关键农艺性状显著相关的位点，并克隆到水稻粒形调控新基因 OsGL3.6 。进一步结合已发表数据，完成了近万份水稻资源/品种的高密度变异图谱的构建，并开发在线育种辅助工具，打造了全球最大的水稻资源育种综合数据平台——RiceAtlas (https://www.cgris.net/RiceAtlas)，研究人员利用该平台快速改良“绥粳4号”水稻粒形。该项研究为水稻精准设计育种的智能决策提供了重要理论依据和数据支撑。
作科所副研究员马小定、博士研究生王浩、助理研究员闫燊等为论文共同第一作者，作科所韩龙植研究员、方沩研究员、贺强研究员等为论文的共同通讯作者。该研究得到国家重点研发计划、农业生物育种重大专项、作物基因资源与育种全国重点实验室、国家自然科学基金、中国农科院科技创新工程等项目的资助。
文章链接：https://doi.org/10.1016/j.molp.2025.03.007
